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Journal articles
Genomes of three tomato pathogens within the Ralstonia solanacearum species complex reveal significant evolutionary divergence
B. Remenant
Bénédicte Coupat-Goutaland
1
A. Guidot
Gilles Cellier
E. Wicker
C. Allen
M. Fegan
Olivier Pruvost
M. Elbaz
A. Calteau
2
G. Salvignol
2
Damien Mornico
3, 2
S. Mangenot
V. Barbe
C. Médigue
2
Philippe Prior
4
M. Elbaz
Author
A. Calteau 2
Author
G. Salvignol 2
Author
Damien Mornico 3, 2
Author IdHAL : dmornico
1
LEM - Laboratoire d'Ecologie Microbienne - UMR 5557 (BAT GREGOR MENDEL (ex 741)-4 et 43 Bvd du 11 Novembre 1918 69622 VILLEURBANNE CEDEX - France)
- INRA - Institut National de la Recherche Agronomique : UMR1418 (France)
- UCBL - Université Claude Bernard Lyon 1 (43, boulevard du 11 novembre 1918, 69622 Villeurbanne cedex - France)
- Université de Lyon (92 rue Pasteur - CS 30122, 69361 Lyon Cedex 07 - France)
- ENVL - Ecole Nationale Vétérinaire de Lyon (France)
- VAS - VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (Université de Lyon, VetAgro Sup, 69280 Marcy l'Etoile (campus vétérinaire); Université de Clermont, VetAgro Sup, 63370 Lempdes (campus agronomique) - France)
- CNRS - Centre National de la Recherche Scientifique : UMR5557 (France)
2
UMR 8030 - Génomique métabolique (GENOSCOPE, 2 rue Gaston Crémieux 91057 Evry Cedex - France)
- GENOSCOPE - Genoscope - Centre national de séquençage [Evry] : DRF/JACOB (2, rue Gaston Crémieux CP5706 91057 EVRY Cedex - France)
- Université Paris-Saclay (Espace Technologique, Bat. Discovery - RD 128 - 2e ét., 91190 Saint-Aubin - France)
- DRF (CEA) - Direction de Recherche Fondamentale (CEA) : DRF/JACOB (Direction de Recherche Fondamentale
Fundamental Research Division
CEA Saclay
91191 Gif-sur-Yvette
- France)
- CEA - Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (Centre de Saclay Centre de Grenoble Centre de Cadarache etc - France)
- UEVE - Université d'Évry-Val-d'Essonne (Boulevard François Mitterrand 91025 Evry Cedex - France)
- CNRS - Centre National de la Recherche Scientifique : UMR8030 (France)
3
Hub Bioinformatique et Biostatistique - Bioinformatics and Biostatistics HUB (C3BI, 25-28 rue du Docteur Roux, 75724 Paris cedex 15 - France)
- Institut Pasteur [Paris] (25-28, rue du docteur Roux, 75724 Paris cedex 15 - France)
- CNRS - Centre National de la Recherche Scientifique : USR3756 (France)
4
UMR PVBMT - Peuplements végétaux et bioagresseurs en milieu tropical (Faculté des Sciences et techniques - Université de La Réunion 15 avenue René Cassin CS92003 97744 Saint-Denis Cédex 9 pour le Cirad Station de Ligne-Paradis - 7 chemin de l'IRAT - 97410 Saint-Pierre - Réunion)
- Cirad - Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement : UMR53-2009 (Siège 42, rue Scheffer 75116 Paris - France)
- IRD - Institut de Recherche pour le Développement (Siège Le Sextant 44, bd de Dunkerque CS 90009 13572 Marseille cedex 02 - France)
- INRA - Institut National de la Recherche Agronomique : USC1424 (France)
- UR - Université de La Réunion : UMRC53 (15, avenue René Cassin - CS92003 -97744 Saint Denis Cedex 9 - Réunion)
Abstract : The Ralstonia solanacearum species complex includes thousands of strains pathogenic to an unusually wide range of plant species. These globally dispersed and heterogeneous strains cause bacterial wilt diseases, which have major socio-economic impacts. Pathogenicity is an ancestral trait in R. solanacearum and strains with high genetic variation can be subdivided into four phylotypes, correlating to isolates from Asia (phylotype I), the Americas (phylotype IIA and IIB), Africa (phylotype III) and Indonesia (phylotype IV). Comparison of genome sequences strains representative of this phylogenetic diversity can help determine which traits allow this bacterium to be such a pathogen of so many different plant species and how the bacteria survive in many different habitats.
Document type :
Journal articles
Domain :
Complete list of metadatas
https://hal-univ-lyon1.archives-ouvertes.fr/hal-02548031
Contributor : Depot 1 Lyon 1 <>
Submitted on : Monday, April 20, 2020 - 2:31:10 PM
Last modification on : Friday, July 17, 2020 - 8:38:03 AM
Contributor : Depot 1 Lyon 1 <>
Submitted on : Monday, April 20, 2020 - 2:31:10 PM
Last modification on : Friday, July 17, 2020 - 8:38:03 AM
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Identifiers
- HAL Id : hal-02548031, version 1
- DOI : 10.1186/1471-2164-11-379
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Citation
B. Remenant, Bénédicte Coupat-Goutaland, A. Guidot, Gilles Cellier, E. Wicker, et al.. Genomes of three tomato pathogens within the Ralstonia solanacearum species complex reveal significant evolutionary divergence. BMC Genomics, BioMed Central, 2010, 11 (1), pp.379. ⟨10.1186/1471-2164-11-379⟩. ⟨hal-02548031⟩
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